Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
H3F3CQ6NXT2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
H3F3CQ6NXT2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms