Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SFRP4Q6FHJ7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP4Q6FHJ7 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP4Q6FHJ7 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP4Q6FHJ7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP4Q6FHJ7 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP4Q6FHJ7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP4Q6FHJ7 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP4Q6FHJ7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP4Q6FHJ7 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP4Q6FHJ7 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP4Q6FHJ7 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP4Q6FHJ7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP4Q6FHJ7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP4Q6FHJ7 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP4Q6FHJ7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP4Q6FHJ7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP4Q6FHJ7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SFRP4Q6FHJ7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms