Protein–RNA interactions for Protein: Q68G75

LEMD1, LEM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD1Q68G75 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
LEMD1Q68G75 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LEMD1Q68G75 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms