Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
WSCD1Q658N2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
WSCD1Q658N2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms