Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ECM29Q5VYK3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ECM29Q5VYK3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms