Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5B0

LCE3E, Late cornified envelope protein 3E, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCE3EQ5T5B0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
LCE3EQ5T5B0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms