Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CEP170Q5SW79 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CEP170Q5SW79 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms