Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
PHYHD1Q5SRE7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PHYHD1Q5SRE7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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