Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC4Q5GLZ8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC4Q5GLZ8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms