Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRDTQ58F21 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
BRDTQ58F21 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms