Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARHGAP29Q52LW3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP29Q52LW3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms