Protein–RNA interactions for Protein: Q30201

HFE, Hereditary hemochromatosis protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFEQ30201 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HFEQ30201 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HFEQ30201 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HFEQ30201 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HFEQ30201 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HFEQ30201 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HFEQ30201 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HFEQ30201 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HFEQ30201 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HFEQ30201 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HFEQ30201 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HFEQ30201 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HFEQ30201 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HFEQ30201 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HFEQ30201 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HFEQ30201 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HFEQ30201 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HFEQ30201 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HFEQ30201 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HFEQ30201 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HFEQ30201 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HFEQ30201 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HFEQ30201 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HFEQ30201 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HFEQ30201 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HFEQ30201 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HFEQ30201 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HFEQ30201 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HFEQ30201 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HFEQ30201 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HFEQ30201 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HFEQ30201 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HFEQ30201 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HFEQ30201 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HFEQ30201 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HFEQ30201 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HFEQ30201 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HFEQ30201 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HFEQ30201 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HFEQ30201 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HFEQ30201 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HFEQ30201 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HFEQ30201 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HFEQ30201 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HFEQ30201 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HFEQ30201 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HFEQ30201 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HFEQ30201 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HFEQ30201 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HFEQ30201 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HFEQ30201 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HFEQ30201 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HFEQ30201 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HFEQ30201 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HFEQ30201 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HFEQ30201 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HFEQ30201 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HFEQ30201 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HFEQ30201 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HFEQ30201 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HFEQ30201 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HFEQ30201 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HFEQ30201 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HFEQ30201 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HFEQ30201 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HFEQ30201 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HFEQ30201 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HFEQ30201 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HFEQ30201 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HFEQ30201 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HFEQ30201 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HFEQ30201 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HFEQ30201 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HFEQ30201 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HFEQ30201 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HFEQ30201 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HFEQ30201 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms