Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CTC1Q2NKJ3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CTC1Q2NKJ3 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms