Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
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COL24A1Q17RW2 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
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COL24A1Q17RW2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
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COL24A1Q17RW2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL24A1Q17RW2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
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COL24A1Q17RW2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
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COL24A1Q17RW2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
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COL24A1Q17RW2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
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COL24A1Q17RW2 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL24A1Q17RW2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
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