Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
SGCBQ16585 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SGCBQ16585 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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