Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
ZIC1Q15915 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ZIC1Q15915 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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