Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS72Q15906 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS72Q15906 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
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