Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USF2Q15853 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USF2Q15853 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USF2Q15853 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USF2Q15853 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USF2Q15853 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USF2Q15853 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USF2Q15853 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
USF2Q15853 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USF2Q15853 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USF2Q15853 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USF2Q15853 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USF2Q15853 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USF2Q15853 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USF2Q15853 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
USF2Q15853 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USF2Q15853 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USF2Q15853 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
USF2Q15853 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USF2Q15853 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USF2Q15853 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USF2Q15853 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USF2Q15853 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USF2Q15853 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USF2Q15853 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USF2Q15853 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USF2Q15853 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USF2Q15853 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USF2Q15853 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USF2Q15853 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USF2Q15853 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
USF2Q15853 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
USF2Q15853 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USF2Q15853 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USF2Q15853 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
USF2Q15853 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USF2Q15853 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USF2Q15853 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USF2Q15853 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USF2Q15853 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USF2Q15853 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
USF2Q15853 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USF2Q15853 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USF2Q15853 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USF2Q15853 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USF2Q15853 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USF2Q15853 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USF2Q15853 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USF2Q15853 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USF2Q15853 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USF2Q15853 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USF2Q15853 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USF2Q15853 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USF2Q15853 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USF2Q15853 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
USF2Q15853 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
USF2Q15853 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
USF2Q15853 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
USF2Q15853 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
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