Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CHRNA6Q15825 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHRNA6Q15825 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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