Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CHRNA2Q15822 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CHRNA2Q15822 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms