Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SYCP1Q15431 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYCP1Q15431 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
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