Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBM39Q14498 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBM39Q14498 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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