Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CSHL1Q14406 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CSHL1Q14406 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms