Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CIRBPQ14011 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CIRBPQ14011 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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