Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RUNX2Q13950 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RUNX2Q13950 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms