Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
GTF2H3Q13889 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GTF2H3Q13889 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms