Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOFQ13790 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOFQ13790 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOFQ13790 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOFQ13790 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOFQ13790 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOFQ13790 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOFQ13790 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOFQ13790 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOFQ13790 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOFQ13790 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOFQ13790 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOFQ13790 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOFQ13790 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOFQ13790 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOFQ13790 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
APOFQ13790 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOFQ13790 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOFQ13790 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOFQ13790 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOFQ13790 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOFQ13790 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
APOFQ13790 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOFQ13790 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOFQ13790 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOFQ13790 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOFQ13790 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOFQ13790 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOFQ13790 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOFQ13790 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOFQ13790 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOFQ13790 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOFQ13790 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOFQ13790 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
APOFQ13790 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOFQ13790 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOFQ13790 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOFQ13790 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOFQ13790 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOFQ13790 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOFQ13790 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOFQ13790 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOFQ13790 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOFQ13790 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOFQ13790 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
APOFQ13790 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOFQ13790 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOFQ13790 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOFQ13790 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOFQ13790 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOFQ13790 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOFQ13790 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOFQ13790 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
APOFQ13790 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APOFQ13790 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOFQ13790 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOFQ13790 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOFQ13790 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOFQ13790 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOFQ13790 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOFQ13790 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOFQ13790 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOFQ13790 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
APOFQ13790 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOFQ13790 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOFQ13790 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOFQ13790 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOFQ13790 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOFQ13790 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
APOFQ13790 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
APOFQ13790 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOFQ13790 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOFQ13790 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
APOFQ13790 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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