Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
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CDH18Q13634 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDH18Q13634 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
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CDH18Q13634 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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CDH18Q13634 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDH18Q13634 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
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