Protein–RNA interactions for Protein: Q13630

TSTA3, GDP-L-fucose synthase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3Q13630 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSTA3Q13630 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TSTA3Q13630 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TSTA3Q13630 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TSTA3Q13630 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms