Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PEX6Q13608 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PEX6Q13608 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms