Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
SCGB2A2Q13296 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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SCGB2A2Q13296 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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SCGB2A2Q13296 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SCGB2A2Q13296 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SCGB2A2Q13296 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SCGB2A2Q13296 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SCGB2A2Q13296 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SCGB2A2Q13296 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SCGB2A2Q13296 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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SCGB2A2Q13296 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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SCGB2A2Q13296 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SCGB2A2Q13296 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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SCGB2A2Q13296 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SCGB2A2Q13296 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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