Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
GRIN2BQ13224 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
GRIN2BQ13224 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
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