Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
DUSP4Q13115 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP4Q13115 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
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