Protein–RNA interactions for Protein: Q12414

TY1B-PL, Transposon Ty1-PL Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-PLQ12414 YSY6YBR162W-A 198 nt1.31□□□□□ -2.2
TY1B-PLQ12414 AI2Q0055 2565 nt1.31□□□□□ -2.2
TY1B-PLQ12414 EAP1YKL204W 1899 nt1.3□□□□□ -2.2
TY1B-PLQ12414 MAD3YJL013C 1548 nt1.3□□□□□ -2.2
TY1B-PLQ12414 PML1YLR016C 615 nt1.3□□□□□ -2.2
TY1B-PLQ12414 21S_rRNA21S_rRNA 3296 nt1.3□□□□□ -2.2
TY1B-PLQ12414 NST1YNL091W 3723 nt1.3□□□□□ -2.2
TY1B-PLQ12414 PMD1YER132C 5262 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-PLQ12414 YTH1YPR107C 627 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-PLQ12414 SLY41YOR307C 1362 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-PLQ12414 RTT101YJL047C 2529 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-PLQ12414 MPO1YGL010W 525 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-PLQ12414 YLR124WYLR124W 345 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-PLQ12414 URA5YML106W 681 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-PLQ12414 NPL6YMR091C 1308 nt1.29□□□□□ -2.2
TY1B-PLQ12414 YDR170W-AYDR170W-A 1323 nt1.28□□□□□ -2.2
TY1B-PLQ12414 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.28□□□□□ -2.2
TY1B-PLQ12414 PEP12YOR036W 867 nt1.28□□□□□ -2.2
TY1B-PLQ12414 CDC37YDR168W 1521 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 YCL076WYCL076W 744 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 NCE101YJL205C 162 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 VMA6YLR447C 1038 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 YBR292CYBR292C 372 nt1.27□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 PAU8YAL068C 363 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 PAU20YOL161C 363 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 PNT1YOR266W 1272 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 BUL2YML111W 2763 nt1.26□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 LSM2YBL026W 288 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 SFG1YOR315W 1041 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 SPB4YFL002C 1821 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 BRO1YPL084W 2535 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 FIG2YCR089W 4830 nt1.25□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 YDR521WYDR521W 336 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 YGL165CYGL165C 579 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 UBC7YMR022W 498 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 SNO1YMR095C 675 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 RPL11BYGR085C 525 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 YKL162CYKL162C 1209 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 RPL11AYPR102C 525 nt1.24□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 BUD30YDL151C 582 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 DPP1YDR284C 870 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 YML084WYML084W 309 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 ECM18YDR125C 1362 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 SEC21YNL287W 2808 nt1.23□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 YDR340WYDR340W 303 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 SMT3YDR510W 306 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 YOL035CYOL035C 303 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 YOR218CYOR218C 420 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 RUD3YOR216C 1455 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 RSM22YKL155C 1887 nt1.22□□□□□ -2.21
TY1B-PLQ12414 VAM6YDL077C 3150 nt1.21□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 CMC4YMR194C-B 222 nt1.21□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 YPL073CYPL073C 486 nt1.21□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 THO2YNL139C 4794 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 DBF20YPR111W 1695 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 CDC10YCR002C 969 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 AIM11YER093C-A 414 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 YGR050CYGR050C 357 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 YIL059CYIL059C 366 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 YNL043CYNL043C 321 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 BRE5YNR051C 1548 nt1.2□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 PAU3YCR104W 375 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 THI80YOR143C 960 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 YAL034C-BYAL034C-B 354 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 SPO24YPR036W-A 204 nt1.19□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 GYL1YMR192W 2163 nt1.18□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 IRA2YOL081W 9240 nt1.18□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 PEP8YJL053W 1140 nt1.18□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 TFA2YKR062W 987 nt1.18□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 YNL114CYNL114C 372 nt1.18□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 YNL184CYNL184C 327 nt1.18□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 ARI1YGL157W 1044 nt1.17□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 HNT3YOR258W 654 nt1.17□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 PLM2YDR501W 1566 nt1.17□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 OST2YOR103C 393 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 GAL7YBR018C 1101 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 HMS1YOR032C 1305 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 SKO1YNL167C 1944 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 PET130YJL023C 1044 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 YOR082CYOR082C 342 nt1.16□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 TRS65YGR166W 1683 nt1.15□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 PIN4YBL051C 2007 nt1.15□□□□□ -2.22
TY1B-PLQ12414 SNF5YBR289W 2718 nt1.15□□□□□ -2.23
TY1B-PLQ12414 YCR007CYCR007C 720 nt1.15□□□□□ -2.23
TY1B-PLQ12414 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt1.15□□□□□ -2.23
TY1B-PLQ12414 HUB1YNR032C-A 222 nt1.15□□□□□ -2.23
TY1B-PLQ12414 IAH1YOR126C 717 nt1.15□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18 ms