Protein–RNA interactions for Protein: Q12186

MSL5, Branchpoint-bridging protein, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSL5Q12186 SNF2YOR290C 5112 nt3.3□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 YCK2YNL154C 1641 nt3.3□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 DAP2YHR028C 2457 nt3.29□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 RAD5YLR032W 3510 nt3.29□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 EAP1YKL204W 1899 nt3.29□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 RPS18AYDR450W 441 nt3.29□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.29□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 RMT2YDR465C 1239 nt3.29□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 YGL042CYGL042C 306 nt3.29□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 TVP18YMR071C 504 nt3.29□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 HOYDL227C 1761 nt3.29□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 YDR338CYDR338C 2088 nt3.29□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 SET1YHR119W 3243 nt3.29□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 YEL1YBL060W 2064 nt3.28□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 RPA12YJR063W 378 nt3.28□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt3.28□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 YBL028CYBL028C 321 nt3.28□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 HHF2YNL030W 312 nt3.28□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 RPL16BYNL069C 597 nt3.28□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 PEX17YNL214W 600 nt3.28□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.28□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 DIE2YGR227W 1578 nt3.28□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 ATG21YPL100W 1491 nt3.28□□□□□ -1.88
MSL5Q12186 VPS9YML097C 1356 nt3.27□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 RPS29BYDL061C 171 nt3.27□□□□□ -1.89 RIP-Chip
MSL5Q12186 snR80snR80 171 nt3.27□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt3.27□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 CYC7YEL039C 342 nt3.27□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YJL202CYJL202C 348 nt3.27□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 SHE2YKL130C 741 nt3.27□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 OST6YML019W 999 nt3.27□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 SSN8YNL025C 972 nt3.27□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YOL160WYOL160W 342 nt3.27□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 SIN4YNL236W 2925 nt3.27□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 VPS73YGL104C 1461 nt3.27□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 MKT1YNL085W 2493 nt3.27□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 MUB1YMR100W 1863 nt3.26□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 OAF3YKR064W 2592 nt3.26□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 SRC1YML034W 2505 nt3.26□□□□□ -1.89 RIP-Chip
MSL5Q12186 PRP22YER013W 3438 nt3.26□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 GPI8YDR331W 1236 nt3.26□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 VEL1YGL258W 621 nt3.26□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YGR265WYGR265W 411 nt3.26□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.26□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 LSM1YJL124C 519 nt3.26□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 FCF2YLR051C 654 nt3.26□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YAR070CYAR070C 300 nt3.26□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YLR302CYLR302C 363 nt3.26□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 SIP18YMR175W 240 nt3.26□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YPR099CYPR099C 357 nt3.26□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 BEM4YPL161C 1902 nt3.26□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 NSP1YJL041W 2472 nt3.26□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YDR442WYDR442W 393 nt3.25□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 RRT13YER066W 558 nt3.25□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 MTC3YGL226W 372 nt3.25□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YGR242WYGR242W 309 nt3.25□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 JIP3YLR331C 378 nt3.25□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt3.25□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YOR385WYOR385W 873 nt3.25□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YPR136CYPR136C 513 nt3.25□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 EBS1YDR206W 2655 nt3.25□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 MED1YPR070W 1701 nt3.24□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 FLO9YAL063C 3969 nt3.24□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 PEP5YMR231W 3090 nt3.24□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 PFK26YIL107C 2484 nt3.24□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 TRX3YCR083W 384 nt3.24□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YEL075CYEL075C 369 nt3.24□□□□□ -1.89 RIP-Chip
MSL5Q12186 TIR2YOR010C 756 nt3.24□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YOR146WYOR146W 306 nt3.24□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YBR259WYBR259W 2067 nt3.24□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 MIP6YHR015W 1980 nt3.23□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YEL032C-AYEL032C-A 162 nt3.23□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YER023C-AYER023C-A 213 nt3.23□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YFR054CYFR054C 579 nt3.23□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 MSL1YIR009W 336 nt3.23□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt3.23□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 PIN4YBL051C 2007 nt3.23□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YPL039WYPL039W 951 nt3.23□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 CEP3YMR168C 1827 nt3.23□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 SPT10YJL127C 1923 nt3.23□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 RDS1YCR106W 2499 nt3.22□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 CPA2YJR109C 3357 nt3.22□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 GSC2YGR032W 5688 nt3.22□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 GPI1YGR216C 1830 nt3.22□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt3.22□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YIL012WYIL012W 342 nt3.22□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 YAR068WYAR068W 486 nt3.22□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 snR13snR13 124 nt3.22□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 NTC20YBR188C 423 nt3.22□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 TIF4631YGR162W 2859 nt3.22□□□□□ -1.89
MSL5Q12186 FRE4YNR060W 2160 nt3.21□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 MAL33YBR297W 1407 nt3.21□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 AKR1YDR264C 2295 nt3.21□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 GAC1YOR178C 2382 nt3.21□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 AST2YER101C 1293 nt3.21□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 SPT4YGR063C 309 nt3.21□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 RPL15AYLR029C 615 nt3.21□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 RPS28BYLR264W 204 nt3.21□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 URA10YMR271C 684 nt3.21□□□□□ -1.9
MSL5Q12186 snR51snR51 107 nt3.21□□□□□ -1.9
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