Protein–RNA interactions for Protein: Q12129

NMD4, Nonsense-mediated decay protein 4, yeastyeast

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NMD4Q12129 HSP10YOR020C 321 nt2.79□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 MSB2YGR014W 3921 nt2.79□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 SNF12YNR023W 1701 nt2.79□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 RIF1YBR275C 5751 nt2.79□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 PMR1YGL167C 2853 nt2.79□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 FRE2YKL220C 2136 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 SEC7YDR170C 6030 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 SSF1YHR066W 1362 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 HPA3YEL066W 540 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YLR302CYLR302C 363 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 UBX4YMR067C 1251 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YNR021WYNR021W 1215 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YPR050CYPR050C 414 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 YPR096CYPR096C 303 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 GCD6YDR211W 2139 nt2.78□□□□□ -1.96
NMD4Q12129 ILS1YBL076C 3219 nt2.78□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 MIX14YDR031W 366 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 TIF35YDR429C 825 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 OTU2YHL013C 924 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 HHT2YNL031C 411 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 GCV2YMR189W 3105 nt2.77□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 PUF4YGL014W 2667 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 RPS17BYDR447C 411 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 RPL23BYER117W 414 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 PRM8YGL053W 714 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 BET4YJL031C 984 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 BPT1YLL015W 4680 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 RIO2YNL207W 1278 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 TRS20YBR254C 528 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 BI4Q0120 1917 nt2.76□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 DNL4YOR005C 2835 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 SPR3YGR059W 1539 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 ESL1YIL151C 3357 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 HMF1YER057C 390 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 YGL015CYGL015C 393 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 AFB1YLR040C 675 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 YLR202CYLR202C 327 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 BER1YLR412W 825 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 RPL33AYPL143W 324 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 ALG14YBR070C 714 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 FIR1YER032W 2631 nt2.75□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 DBP7YKR024C 2229 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 YBT1YLL048C 4986 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 GDI1YER136W 1356 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 UBP16YPL072W 1500 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 ADK1YDR226W 669 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 SPO13YHR014W 876 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 FYV4YHR059W 393 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 YNL046WYNL046W 519 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 TCB2YNL087W 3537 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 TOM1YDR457W 9807 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 SSF2YDR312W 1362 nt2.74□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 ATG13YPR185W 2217 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 GPI17YDR434W 1605 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 MET32YDR253C 576 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 YER189WYER189W 369 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 NOP19YGR251W 591 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 CIC1YHR052W 1131 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 IST3YIR005W 447 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 YLR297WYLR297W 390 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 ARR2YPR200C 393 nt2.73□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 YLR001CYLR001C 2589 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 YIL166CYIL166C 1629 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 snR76snR76 109 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 HNT1YDL125C 477 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 MTC7YEL033W 420 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 GCD10YNL062C 1437 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 ISU1YPL135W 498 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 NSL1YPL233W 651 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 LEU3YLR451W 2661 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 GYP7YDL234C 2241 nt2.72□□□□□ -1.97
NMD4Q12129 BAS1YKR099W 2436 nt2.71□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 TFC4YGR047C 3078 nt2.71□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.71□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.71□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.71□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.71□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 GPI19YDR437W 423 nt2.71□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 EAF6YJR082C 342 nt2.71□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 YKR033CYKR033C 426 nt2.71□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 LSM2YBL026W 288 nt2.71□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 SWM2YNR004W 441 nt2.71□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt2.71□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 YOL134CYOL134C 390 nt2.71□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 NPR3YHL023C 3441 nt2.71□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 TPS2YDR074W 2691 nt2.7□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 AHC2YCR082W 387 nt2.7□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 ARV1YLR242C 966 nt2.7□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 FPR1YNL135C 345 nt2.7□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt2.7□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 PHO80YOL001W 882 nt2.7□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 YOR385WYOR385W 873 nt2.7□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 INP52YNL106C 3552 nt2.7□□□□□ -1.98
NMD4Q12129 NDT80YHR124W 1884 nt2.7□□□□□ -1.98
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