Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 ARF1YDL192W 546 nt4.96□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 YDR250CYDR250C 276 nt4.96□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 RIP1YEL024W 648 nt4.96□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 DPB11YJL090C 2295 nt4.96□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 SSP1YHR184W 1716 nt4.96□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 ELM1YKL048C 1923 nt4.95□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 YAP1802YGR241C 1707 nt4.95□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 SAE3YHR079C-A 276 nt4.95□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 YBL053WYBL053W 375 nt4.95□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 snR10snR10 245 nt4.95□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 MRP10YDL045W-A 288 nt4.94□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 LTP1YPR073C 486 nt4.94□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 SWD3YBR175W 948 nt4.94□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 RIM20YOR275C 1986 nt4.94□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 AVT1YJR001W 1809 nt4.93□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 MIP6YHR015W 1980 nt4.93□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 KIP2YPL155C 2121 nt4.93□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 MSC2YDR205W 2175 nt4.93□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 OLI1Q0130 231 nt4.93□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 RAD27YKL113C 1149 nt4.93□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt4.93□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 ORC2YBR060C 1863 nt4.93□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 TOM5YPR133W-A 153 nt4.93□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 TEL1YBL088C 8364 nt4.93□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 SOK2YMR016C 2358 nt4.93□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 GLN4YOR168W 2430 nt4.93□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 MET12YPL023C 1974 nt4.93□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 AIP1YMR092C 1848 nt4.93□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 MSH4YFL003C 2637 nt4.93□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 ARG2YJL071W 1725 nt4.92□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 BUD5YCR038C 1929 nt4.92□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 RPS29BYDL061C 171 nt4.92□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 MTC3YGL226W 372 nt4.92□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 NAN1YPL126W 2691 nt4.92□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 GAC1YOR178C 2382 nt4.92□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 BLM10YFL007W 6432 nt4.91□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 SSH1YBR283C 1473 nt4.91□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 YBR259WYBR259W 2067 nt4.91□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 DAP2YHR028C 2457 nt4.91□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 PDR10YOR328W 4695 nt4.91□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 OPT2YPR194C 2634 nt4.9□□□□□ -1.62
TFB4Q12004 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt4.9□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 ATP15YPL271W 189 nt4.9□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 FEX2YPL279C 1128 nt4.9□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 MES1YGR264C 2256 nt4.89□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 MNR2YKL064W 2910 nt4.89□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 SRP68YPL243W 1800 nt4.89□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 VPS41YDR080W 2979 nt4.89□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 NAG1YGR031C-A 492 nt4.89□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 YLR053CYLR053C 327 nt4.89□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 CYB5YNL111C 363 nt4.89□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 YPL025CYPL025C 558 nt4.89□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 HFA1YMR207C 6372 nt4.88□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 RPS24AYER074W 408 nt4.88□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 PEX5YDR244W 1839 nt4.88□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 OAF1YAL051W 3144 nt4.87□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 TRM44YPL030W 1704 nt4.87□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 YNL057WYNL057W 333 nt4.87□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 RPL21BYPL079W 483 nt4.87□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 CYM1YDR430C 2970 nt4.87□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 REV1YOR346W 2958 nt4.87□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 RAT1YOR048C 3021 nt4.87□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 NNK1YKL171W 2787 nt4.87□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 RPS0AYGR214W 759 nt4.86□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 PAU23YLR037C 375 nt4.86□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 MIM2YLR099W-A 264 nt4.86□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 YMR105W-AYMR105W-A 195 nt4.86□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 EBS1YDR206W 2655 nt4.86□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 NUP60YAR002W 1620 nt4.86□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 YKR033CYKR033C 426 nt4.85□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 ROK1YGL171W 1695 nt4.85□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 NHX1YDR456W 1902 nt4.85□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 TRS85YDR108W 2097 nt4.85□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 SRB4YER022W 2064 nt4.85□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 SBE2YDR351W 2595 nt4.84□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 LRE1YCL051W 1752 nt4.84□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 RPS23AYGR118W 438 nt4.84□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt4.84□□□□□ -1.63
TFB4Q12004 CUL3YGR003W 2235 nt4.83□□□□□ -1.64
TFB4Q12004 TIM8YJR135W-A 264 nt4.83□□□□□ -1.64
TFB4Q12004 RFC3YNL290W 1023 nt4.83□□□□□ -1.64
TFB4Q12004 PEX11YOL147C 711 nt4.83□□□□□ -1.64
TFB4Q12004 YML057C-AYML057C-A 390 nt4.82□□□□□ -1.64
TFB4Q12004 MGR2YPL098C 342 nt4.82□□□□□ -1.64
TFB4Q12004 PHO2YDL106C 1680 nt4.82□□□□□ -1.64
TFB4Q12004 ATP25YMR098C 1839 nt4.81□□□□□ -1.64
TFB4Q12004 YDL247W-AYDL247W-A 75 nt4.81□□□□□ -1.64
TFB4Q12004 YGR269WYGR269W 327 nt4.81□□□□□ -1.64
TFB4Q12004 ECM34YHL043W 513 nt4.81□□□□□ -1.64
TFB4Q12004 NHP6AYPR052C 282 nt4.81□□□□□ -1.64
TFB4Q12004 ISW2YOR304W 3363 nt4.81□□□□□ -1.64
TFB4Q12004 PDR15YDR406W 4590 nt4.8□□□□□ -1.64
TFB4Q12004 APC1YNL172W 5247 nt4.8□□□□□ -1.64
TFB4Q12004 GRC3YLL035W 1899 nt4.8□□□□□ -1.64
TFB4Q12004 OAF3YKR064W 2592 nt4.8□□□□□ -1.64
TFB4Q12004 YJL206CYJL206C 2277 nt4.79□□□□□ -1.64
TFB4Q12004 MCH4YOL119C 1506 nt4.79□□□□□ -1.64
TFB4Q12004 PAU13YHL046C 363 nt4.79□□□□□ -1.64
TFB4Q12004 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt4.79□□□□□ -1.64
TFB4Q12004 VIP1YLR410W 3441 nt4.79□□□□□ -1.64
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