Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
IFFO1Q0D2I5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IFFO1Q0D2I5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms