Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SRSF4Q08170 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms