Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN3Q08043 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms