Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CXCL9Q07325 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCL9Q07325 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms