Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX4Q06945 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX4Q06945 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX4Q06945 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX4Q06945 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX4Q06945 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SOX4Q06945 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX4Q06945 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX4Q06945 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX4Q06945 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX4Q06945 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX4Q06945 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX4Q06945 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX4Q06945 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX4Q06945 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX4Q06945 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX4Q06945 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SOX4Q06945 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOX4Q06945 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOX4Q06945 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SOX4Q06945 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOX4Q06945 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms