Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CALD1Q05682 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CALD1Q05682 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms