Protein–RNA interactions for Protein: Q05549

HRQ1, ATP-dependent helicase HRQ1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HRQ1Q05549 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.79□□□□□ -1.8
HRQ1Q05549 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.79□□□□□ -1.8
HRQ1Q05549 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.79□□□□□ -1.8
HRQ1Q05549 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.79□□□□□ -1.8
HRQ1Q05549 MRPL31YKL138C 396 nt3.79□□□□□ -1.8
HRQ1Q05549 YLR230WYLR230W 306 nt3.79□□□□□ -1.8
HRQ1Q05549 YNL043CYNL043C 321 nt3.79□□□□□ -1.8
HRQ1Q05549 YAF9YNL107W 681 nt3.79□□□□□ -1.8
HRQ1Q05549 AUS1YOR011W 4185 nt3.79□□□□□ -1.8
HRQ1Q05549 URA2YJL130C 6645 nt3.79□□□□□ -1.8
HRQ1Q05549 DRS2YAL026C 4068 nt3.79□□□□□ -1.8
HRQ1Q05549 MSR1YHR091C 1932 nt3.78□□□□□ -1.8
HRQ1Q05549 MDN1YLR106C 14733 nt3.78□□□□□ -1.8
HRQ1Q05549 PSF1YDR013W 627 nt3.78□□□□□ -1.8
HRQ1Q05549 YAL031W-AYAL031W-A 309 nt3.78□□□□□ -1.8
HRQ1Q05549 ADI1YMR009W 540 nt3.78□□□□□ -1.8
HRQ1Q05549 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt3.78□□□□□ -1.8
HRQ1Q05549 YMR316C-AYMR316C-A 312 nt3.78□□□□□ -1.8
HRQ1Q05549 PEX17YNL214W 600 nt3.78□□□□□ -1.8
HRQ1Q05549 RED1YLR263W 2484 nt3.78□□□□□ -1.8
HRQ1Q05549 KIP3YGL216W 2418 nt3.78□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt3.77□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 YGR073CYGR073C 372 nt3.77□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 AIM26YKL037W 357 nt3.77□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 YKL156C-AYKL156C-A 117 nt3.77□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 YLR302CYLR302C 363 nt3.77□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 YNL179CYNL179C 438 nt3.77□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 YPL039WYPL039W 951 nt3.77□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 REC8YPR007C 2043 nt3.77□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 SEC6YIL068C 2418 nt3.76□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 YLR001CYLR001C 2589 nt3.76□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 CBP2YHL038C 1893 nt3.76□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 YPL080CYPL080C 327 nt3.76□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 HFD1YMR110C 1599 nt3.76□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 MET10YFR030W 3108 nt3.75□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 STU1YBL034C 4542 nt3.75□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 YER091C-AYER091C-A 222 nt3.75□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 FMP10YER182W 735 nt3.75□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 SIP18YMR175W 240 nt3.75□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 HHT2YNL031C 411 nt3.75□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 MRPL50YNR022C 420 nt3.75□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 MCD4YKL165C 2760 nt3.75□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 KRE5YOR336W 4098 nt3.75□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 NIC96YFR002W 2520 nt3.75□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 YDL068WYDL068W 330 nt3.74□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 SMT3YDR510W 306 nt3.74□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 TAF6YGL112C 1551 nt3.74□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 PDX1YGR193C 1233 nt3.74□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 YJL169WYJL169W 369 nt3.74□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 PMT6YGR199W 2280 nt3.74□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 CSR2YPR030W 3366 nt3.74□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 EMP70YLR083C 2004 nt3.73□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 IMD4YML056C 1575 nt3.73□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 YDR413CYDR413C 576 nt3.73□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt3.73□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 RPL15AYLR029C 615 nt3.73□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 YAR070CYAR070C 300 nt3.73□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 VTI1YMR197C 654 nt3.73□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 HHF1YBR009C 312 nt3.73□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 SWT1YOR166C 1377 nt3.73□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 MES1YGR264C 2256 nt3.73□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 OST1YJL002C 1431 nt3.72□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 JJJ2YJL162C 1752 nt3.72□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 snR65snR65 100 nt3.72□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 NHP2YDL208W 471 nt3.72□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 AIM11YER093C-A 414 nt3.72□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 RTT105YER104W 627 nt3.72□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 YHR214W-AYHR214W-A 486 nt3.72□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 YAR068WYAR068W 486 nt3.72□□□□□ -1.81
HRQ1Q05549 UBP5YER144C 2418 nt3.71□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 SEG1YMR086W 2883 nt3.71□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 MED1YPR070W 1701 nt3.71□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 HMRA2YCR096C 360 nt3.71□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 RRT13YER066W 558 nt3.71□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 RNR4YGR180C 1038 nt3.71□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 PFY1YOR122C 381 nt3.71□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt3.71□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 YOR385WYOR385W 873 nt3.71□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 NSL1YPL233W 651 nt3.71□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 YRM1YOR172W 2361 nt3.71□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 APL4YPR029C 2499 nt3.71□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 YJR003CYJR003C 1560 nt3.71□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 YMR317WYMR317W 3423 nt3.7□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 ERG28YER044C 447 nt3.7□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 YIL054WYIL054W 318 nt3.7□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 POG1YIL122W 1056 nt3.7□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 JIP3YLR331C 378 nt3.7□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 YLR416CYLR416C 399 nt3.7□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 UBC7YMR022W 498 nt3.7□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 snR13snR13 124 nt3.7□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 DGK1YOR311C 873 nt3.7□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 DIE2YGR227W 1578 nt3.7□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 KIN82YCR091W 2163 nt3.7□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 ALY1YKR021W 2748 nt3.7□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 YJR030CYJR030C 2238 nt3.7□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 NSP1YJL041W 2472 nt3.69□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 MKT1YNL085W 2493 nt3.69□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 DNM1YLL001W 2274 nt3.69□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 CIN8YEL061C 3003 nt3.69□□□□□ -1.82
HRQ1Q05549 MRH1YDR033W 963 nt3.69□□□□□ -1.82
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