Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
UBE3AQ05086 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
UBE3AQ05086 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms