Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
DHODHQ02127 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
DHODHQ02127 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms