Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
E2F1Q01094 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
E2F1Q01094 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms