Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.45
CLTCQ00610 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
CLTCQ00610 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms