Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDK17Q00537 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDK17Q00537 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms