Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CDK16Q00536 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CDK16Q00536 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms